উপজেলা নির্বাহী অফিসারের কার্যালয়, চুনারুঘাট, হবিগঞ্জ এর সাংগঠনিক কাঠামো সকল উপজেলার মতই। উপজেলা নির্বাহী অফিসারের কার্যালয়, চুনারুঘাট, হবিগঞ্জ এর সাংগঠনিক কাঠামো নিন্ম রূপ:
উপজেলা নির্বাহী অফিসার
অফিস সুপার০১
সি এ কাম ইউ ডি এ-০১
স্টেনো টাইপিষ্ট-০১
অফিস সহকারী -০৩
হিসাব সহকারী -০১
সার্টিফিকেট সহকারী -০১
ডি এম ও -০১
দপ্তরী -০১
জারী কারক -০২
এম এল এস এস -০৩
নৈশ প্রহরী -০৩
ঝাড়ুদার -০২
ড্রাইভার-০১
পরিকল্পনা ও বাস্তবায়নে: মন্ত্রিপরিষদ বিভাগ, এটুআই, বিসিসি, ডিওআইসিটি ও বেসিস